制定科研計劃，組織管理重點科研任務，負責協調全國藏學研究事宜，組織國內外學術交流、課題合作和科研成果評獎、專業技術職務評審和培訓等。

內設科研處、國際交流與合作處、國內協調處、智庫辦公室。